Хеликон
Кутузовский проспект, 88 121374 Россия, Москва
+7 (499) 705-50-50, +7 (499) 705-50-50, mail@helicon.ru

Вебинар #HeliconOnline: Вебинар от QIAGEN по биоинформатическому анализу данных секвенирования SARS-CoV-2

02

апр '20

16-00

Вебинар «Биоинформатический анализ данных секвенирования SARS-CoV-2 на платформе Oxford Nanopore с помощью программного обеспечения CLC Genomics Workbench, QIAGEN»
Время: 16:00 – 17:00 (МСК), 20:00 – 21:00 (МСК)
Регистрация по ссылке>>

При анализе пандемии COVID-19 проводится секвенирование SARS-CoV-2 на разных платформах NGS (MGI, Illumina, Oxford Nanopore, Ion Torrent), а также капиллярное секвенирование. В зависимости от методов подготовки проб и библиотек, метатранскриптомные данные могут указывать на разную вирусную нагрузку.

Темы, которые будут обсуждаться на вебинаре:

  • Передовой опыт использования платформы QIAGEN CLC Genomics Workbench для биоинформатического анализа;
  • Контроль качества, отсечение адаптерных последовательностей, стратегии для исключения ридов ДНК хозяина и обогащения данных секвенирования вируса;
  • Последовательность действия при сборке контигов и идентификации штаммов;
  • Демонстрация картирования ридов, поиска вариантов и получения консенсусной последовальности – необходимых шагов для получения высококачественных геномных данных, пригодных для филогенетического анализа и публикации.

Докладчик: Лейф Шаузер, PhD в области молекулярной генетики растений, профессор биоинформатики, Орхусский Университет, Дания, ведущий сотрудник QIAGEN в области биоинформатики.


Возврат к списку мероприятий