Хеликон
Кутузовский проспект, 88 121374 Россия, Москва
+7 (499) 705-50-50, +7 (499) 705-50-50, mail@helicon.ru

Наборы для полногеномной амплификации

Наборы для полногеномной амплификации REPLI-g

Линейка продуктов REPLI-g позволяет проводить изотермическую амплификацию генома по технологии множественного вытеснения цепи – Multiple Displacement Amplification (MDA).
Данная технология включает связывание рандомных гексамеров с денатурированной ДНК, с последующим синтезом цепи полимеразой Phi29 при постоянной температуре. В дальнейшем, каждая вытесненная цепь служит матрицей для амплификации ДНК.

Схема амплификации REPLI-g

Подробнее>>


Полимераза Ph 29 движется вдоль цепи ДНК-матрицы, вытесняя комплементарную цепь. Вытесненная цепь становится матрицей для репликации, что позволяет получать высокий выход ДНК.

Ключевым компонентом наборов REPLI-g является полимераза Phi 29, которая обладает 3'→5' экзонуклеазной активностью (корректирующей активностью), так же, она в 1000 раз точнее Taq-полимеразы, которая традиционно используется в методах WGA (whole genome amplification).

Сравнение полимеразы Phi 29 и Taq-полимеразы


При обнаружении вторичных структур ДНК, Taq-полимераза может приостанавливать синтез, скользить или диссоциировать от матрицы, что может привести к неточной амплификации ДНК, неполному покрытию локусов и коротким размерам фрагментов. В наборах REPLI-g используется полимераза Phi29, которая смещает вторичные структуры, обеспечивая точную и очень равномерную амплификацию всего генома.

Щелочная денатурация, оптимизированный буфер REPLI-g и полимераза Phi 29 позволяют снизить количество ошибок и получить высокую однородность амплификации генома с минимальными отклонениями в процессе пробоподготовки и анализа. Кроме того, такой подход позволяет получать длинные фрагменты ДНК до 100 kb. Для проведения изотермической амплификации не требуется термоциклер, так как реакция идет при постоянной температуре.

Линейка наборов для амплификации REPLI-g
REPLI-g Single Cell REPLI-g Mini REPLI-g UltraFast Mini REPLI-g Midi REPLI-g Screening REPLI-g FFPE REPLI-g Mitochondrial DNA
Стартовый материал Единичные клетки, гДНК Очищенная гДНК, кровь, клетки Очищенная гДНК, кровь, клетки FFPE- образцы, очищенная гДНК из FFPE-образцов Очищенная гДНК
Доступны протоколы и для других образцов*
Количество стартового материала Единичная клетка, 2–1000 клеток, ткани очищенная гДНК (1–10 нг) >10 нг гДНК, 0.5 мкл крови или клеток (>600 клеток/мкл) >10 нг гДНК, 0.5 мкл крови или клеток (>600 клеток/мкл) Срез (1 см в диаметре, 10–40 мкм толщины); >100 нг гДНК >1 нг очищенной гДНК
Выход реакции (мкг/реакцию) 40 10 7–10 40 8 Стандартный ≤10; высокий ≤40 3–5
Время реакции 8–16 ч 10–16 ч 1.5 ч 8–16 ч 12–16 ч Стандартный – 4 ч; высокий – 10 ч 8 ч
Время ручного труда 15 мин 15 мин 15 мин 15 мин 15 мин 40 мин 15 мин
Формат Одиночные пробирки Одиночные пробирки Одиночные пробирки Одиночные пробирки Планшет Одиночные пробирки Одиночные пробирки
Набор для полногеномной амплификации REPLI-g UltraFast Mini Kit

Набор позволяет провести полногеномную амплификацию ДНК с выходом продукта реакции 7-10 мкг.

Подробнее

Производитель: Qiagen

Набор для полногеномной амплификации REPLI-g Midi Kit

Набор позволяет провести полногеномную амплификацию ДНК с выходом продукта реакции до 40 мкг.

Подробнее

Производитель: Qiagen

Набор для полногеномной амплификации REPLI-g Mini Kit

Набор позволяет провести полногеномную амплификацию ДНК с выходом продукта реакции до 10 мкг.

Подробнее

Производитель: Qiagen

Набор для амплификации митохондриальной ДНК из образца геномной ДНК REPLI-g Mitochondrial DNA Kit

Набор позволяет выделить митохондриальную ДНК из образца геномной ДНК.

Подробнее

Производитель: Qiagen

Набор для амплификации кДНК из единичной клетки REPLI-g WTA Single Cell Kit

Набор позволяет провести обратную транскрипцию и амплификацию кДНК из единичной клетки для дальнейшего секвенирования NGS.

Подробнее

Производитель: Qiagen

Набор для полногеномной амплификации из единичной клетки REPLI-g Single Cell Kit

Набор позволяет провести полногеномную амплификацию из единичной клетки для дальнейшего секвенирования NGS.

Подробнее

Производитель: Qiagen